| General information of RDP00674 | |
|---|---|
| Gene Symbol: | GACAT2 |
| RefSeq ID: | NR_120598 |
| Repeat coordinate: | chr18:8705587-8705611 (-) |
| Repeat size: | 8 |
| Repeat region: | intron |
| Repeat unit: | CGG |
| Repeat conservation: | PhastCons_score: 0.034; Repeat Conservation from UCSC Genome Browser |
| Amino acid sequence: | - |
| Gene expression and GO annotation: | BioGPS |
| Protein expression: | Human Protein Altas |
| Gene conservation: | Gene Conservation from UCSC Genome Browser |
| Mapping repeat track to ExAC: |
|---|
Chr
Pos
dbSNP_ID
Ref
Alt
Qual
18
8705611
.
G
GCCA
306.39
| Mapping repeat track to gnomAD: |
|---|
Chr
Pos
dbSNP_ID
Ref
Alt
Qual
18
8705585
rs529374906
ACGCCGCCGC
ACGCCGCCGCCGCCGCCGCCGC,ACGCCGCCGCCGC,A,ACGC,ACGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGC,ACGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGC
5525159.06
18
8705590
.
G
A
1082841.37
18
8705591
.
C
G
1082994.54
18
8705597
.
CCGCCGCCGCCGCCGT
C
12508.83
18
8705603
.
CCGCCGCCGT
CCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGTCGCCGCCGT,C,CCGCCGCCGCCGCCGTCGCCGCCGT,CCGCCGCCGTCGTCGCCGCCGT,CCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGTCGCCGCCGT
6004.72
18
8705604
.
C
T
7102.22
18
8705606
.
C
CCGCCGT,T,CCGCCGTCGT,CCGCCGCCGCCGTCGTCGT
17814.94
18
8705609
rs190839699
C
CCGT,CCGCCGCCGCCGCCGT,CCGCCGT,CCGTCGT,CCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGT
142740.89
18
8705610
.
C
CGCCGCCGCCGCT,CGCCGCCGCCGCCGCT
3546.93
| Mapping repeat track to Kaviar: |
|---|
Chr
Pos
dbSNP_ID
Ref
Alt
Qual
18
8705585
.
ACGCCGC
ACGCCGCCGC,ACGCCGCCGCCGC,ACGCCGCCGCCGCCGCCGC,A
.
18
8705585
.
ACGCCGCCGC
ACGCCGCCGCCGC,ACGCCGCCGCCGCCGCCGCCGC,A
.
18
8705609
rs190839699
C
T
.
18
8705609
.
C
CCGCCGT,CCGT
.