| General information of RDP00632 | |
|---|---|
| Gene Symbol: | LOC105371730 |
| RefSeq ID: | NR_136413 |
| Repeat coordinate: | chr17:32142451-32142499 (-) |
| Repeat size: | 16 |
| Repeat region: | exon |
| Repeat unit: | CGG |
| Repeat conservation: | PhastCons_score: 0.338; Repeat Conservation from UCSC Genome Browser |
| Amino acid sequence: | - |
| Gene expression and GO annotation: | BioGPS |
| Protein expression: | Human Protein Altas |
| Gene conservation: | Gene Conservation from UCSC Genome Browser |
| Mapping repeat track to ExAC: |
|---|
Chr
Pos
dbSNP_ID
Ref
Alt
Qual
17
32142446
.
TCGTCCCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGC
TCGCCGCCGC,T
31135.18
17
32142449
rs749392762
TCCCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGC
CCCCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGC,T,GCCCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGC
42518.72
17
32142451
rs868242500
CCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCG
CCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCG,CCCGCCGCCGCCG,CCCG,CCCGCCG,CCCGCCGCCG,C
1469952.12
17
32142453
rs753704561
CG
C
1722371.86
17
32142454
rs775802553
G
C
1734697.01
17
32142457
.
G
A
1690387.68
17
32142460
.
G
A
1609418.84
17
32142461
rs763379204
C
T
1541808.53
17
32142462
.
C
A
1520261.86
17
32142463
.
G
GT
1534118.52
17
32142464
rs764653293
CCG
C,TCG
1516417.57
17
32142466
rs752023342
G
A,C
1486031.71
17
32142468
.
C
A
1143746.07
17
32142469
.
G
A
1129735.33
17
32142471
.
C
A,T
1009340.47
17
32142472
.
G
A
1012690.09
17
32142474
.
C
A
885905.69
17
32142475
rs572261200
G
A
891425.78
17
32142476
.
CCG
C
254113.14
17
32142477
.
C
A
251464.09
17
32142478
.
G
A
262185.42
17
32142480
.
C
A
173204.80
17
32142481
.
G
A
158285.52
17
32142483
.
C
A
113621.74
17
32142484
.
G
A
109904.44
17
32142486
.
C
A
95168.32
17
32142487
.
G
A
119747.91
17
32142489
.
C
A
112494.47
17
32142490
.
G
A
94733.36
17
32142492
.
C
A
83504.85
17
32142493
.
G
A
93601.31
17
32142495
.
C
A
649.32
17
32142496
.
G
A
703.70
17
32142497
.
C
T
366.16
17
32142498
.
C
A
199.01
| Mapping repeat track to gnomAD: |
|---|
Chr
Pos
dbSNP_ID
Ref
Alt
Qual
17
32142446
.
TCGTCCCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGC
TCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGC,TCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGC,TCGCCGC,TCGCCGCCGCCGCCGCCGC,TCGCCGCCGCCGC,T
44585.30
17
32142449
rs749392762
TCCCCGCCGCCGCCGC
T,CCCCCGCCGCCGCCGC,TCGCCGCCGCCGC,TCGCCGCCGC
137094.03
17
32142451
rs868242500
CCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCG
C,CCCG,CCCGCCGCCG,CCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCG,CCCGCCGCCGCCGCCGCCG,CCCGCCGCCGCCGCCG
7613755.38
17
32142452
.
CCGCCG
C
7322843.15
17
32142460
.
G
GTCGTCC
6026246.05
17
32142461
rs763379204
C
T
5648898.48
17
32142463
.
G
GCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGTCC,GTCC
5620147.26
17
32142464
rs764653293
C
T
5349263.70
17
32142465
.
C
CGCCGCCGCG,CGCCGCA
5330500.85
17
32142466
rs752023342
G
C,GCCGTCGTCC
5329695.68
17
32142467
.
C
T
3258591.41
17
32142469
.
G
GCCGCCC
3238746.37
17
32142470
.
C
A
2671350.24
17
32142471
.
C
CGCCGCCACA
2666179.55
17
32142472
.
G
A
2665426.14
17
32142476
.
C
A
578352.25
17
32142477
.
CGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCACA
C
572922.47
17
32142478
.
G
T
575293.15
17
32142484
.
G
A
55616.29
17
32142486
.
C
A
37596.81
17
32142487
.
G
A
38768.58
17
32142489
.
C
A
35888.85
17
32142493
.
G
A
34152.55
17
32142495
.
C
A,CACA
1898.24
17
32142496
.
G
A,GCCA
10813.17
17
32142498
.
C
A,CACA,CGCCACA
9780.78
| Mapping repeat track to Kaviar: |
|---|
Chr
Pos
dbSNP_ID
Ref
Alt
Qual
17
32142449
rs771068395
TCCCCGCCGCCGCCGCCGC
T
.
17
32142449
rs749392762
TCCCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGC
TCGCCGCCGC,T
.
17
32142451
.
CCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCG
C
.
17
32142451
rs754162268
CCCG
C
.
17
32142451
.
CCCGCCG
CCCG,C
.
17
32142451
rs764030181
CCCGCCGCCG
CCCGCCG,C
.
17
32142451
.
CCCGCCGCCGCCG
CCCGCCG,CCCGCCGCCG,C
.
17
32142451
rs560388277
CCCGCCGCCGCCGCCG
CCCGCCGCCG,CCCGCCGCCGCCG,CCCGCCGCCGCCGCCGCCG,C
.
17
32142451
rs760466239
CCCGCCGCCGCCGCCGCCG
CCCG,CCCGCCGCCGCCGCCG,C
.
17
32142451
rs767383196
CCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCG
CCCGCCG,CCCGCCGCCGCCGCCG,CCCGCCGCCGCCGCCGCCG,C
.
17
32142451
rs751404391
CCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCG
CCCG,CCCGCCG,CCCGCCGCCG,CCCGCCGCCGCCG,CCCGCCGCCGCCGCCG,CCCGCCGCCGCCGCCGCCG,CCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCG,CCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCG,C
.
17
32142451
.
CCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCG
C
.
17
32142451
.
CCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCG
C
.
17
32142451
.
CCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCG
C
.
17
32142451
.
CCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCG
C
.
17
32142452
.
CCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGC
C
.
17
32142453
rs775802553
CG
CA,CC,C
.
17
32142461
rs763379204
C
T
.
17
32142463
.
G
GTCC
.
17
32142464
rs764653293
C
T
.
17
32142466
rs752023342
G
C
.
17
32142467
.
C
T
.
17
32142469
.
G
C
.
17
32142475
rs572261200
G
C
.
17
32142485
.
C
G
.
17
32142496
.
G
A
.
17
32142498
.
C
A
.