General information of RDP00564 | |
---|---|
Gene Symbol: | NTM |
RefSeq ID: | NM_001048209 |
Repeat coordinate: | chr11:131789549-131789636 (+) |
Repeat size: | 29 |
Repeat region: | intron |
Repeat unit: | GAA |
Repeat conservation: | PhastCons_score: 0.000; Repeat Conservation from UCSC Genome Browser |
Amino acid sequence: | - |
Gene expression and GO annotation: | BioGPS |
Protein expression: | Human Protein Altas |
Gene conservation: | Gene Conservation from UCSC Genome Browser |
Mapping repeat track to DisGeNET: | |||||
---|---|---|---|---|---|
Disease_name | RefSeq | Score | NofPmids | NofSnps | Source |
Major Depressive Disorder | NM_001048209 | 0.31 | 1 | 0 | PSYGENET |
Mapping repeat track to gnomAD: |
---|
Chr
Pos
dbSNP_ID
Ref
Alt
Qual
11
131789420
rs774212449
AAAGAAGAAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAG
AGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAG,GAAGAAGAAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAG,AGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAG,A,AAAGAAGAAG
22326.48
11
131789421
rs765737941
AAGAAGAAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAG
AAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAG,AAAGAAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAG,AAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAG,A
27626.05
11
131789424
rs532434495
AAGAAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAG
AAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAG,A,AAAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAG
104664.01
11
131789429
rs199925007
GGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA,GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA,GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA,GGAAGAA,G
544153.78
11
131789445
.
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
G,GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
103290.65
11
131789448
.
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
G,GGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA,GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
165066.97
11
131789451
.
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
G,GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
127580.58
11
131789454
.
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA,G,GGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA,GGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
156182.42
11
131789457
.
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA,G,GGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
136395.28
11
131789460
.
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA,G,GAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA,GAAGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
178590.25
11
131789466
.
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
GGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA,GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA,GAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA,G
139941.11
11
131789469
.
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
GAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA,GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA,G,GGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA,GAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
168434.76
11
131789472
.
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGA
GAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGA,GAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGA,GGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGA,G
251262.93
11
131789475
.
GAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAA
GAAAGAAGAAGAA,GAAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAA,GGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAA,G
306568
11
131789487
.
GAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
G,GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA,GAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA,GGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA,GGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
451454.12
11
131789488
rs866013652
AAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAG
AAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAG,AAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAG,AAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAG,A,AAAGAAG
454772.95
11
131789491
rs202238449
AGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAG
AAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAG,AAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAG,AAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAG,AAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAG,A
567833.01
11
131789498
.
AAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAG
AAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAG,AAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAG,AAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAG,AAAGAAG,A
319749.16
11
131789501
.
AAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAG
AAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAG,AAAGAAGAAGAAG,AAAGAAGAAG,A,AAAG
302554.61
11
131789502
.
AGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAG
A,AAAGAAG
393975.49
11
131789504
rs201002369
AAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAG
AAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAG,AAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAG,GAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAG,A,AAAGAAGAAGAAGAAGAAG
256693.77
11
131789507
.
AAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAG
AAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAG,GAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAG,A
180573.84
11
131789509
.
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGA
G,GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGA
179722.36
11
131789513
.
AAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAG
AAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAG,GAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAG,A
191904.42
11
131789515
.
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
G,GAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA,GA
136861.94
11
131789516
.
AAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAG
GAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAG,A
158714.78
11
131789518
.
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
G,GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA,GGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA,GGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
132923.46
11
131789521
.
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
GGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA,G,GAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
132557.54
11
131789524
.
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGA
G
149874.19
11
131789528
.
AAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAG
A
132324.44
11
131789529
.
AGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAG
A
126873.77
11
131789530
.
GAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
G,GGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
131750.92
11
131789532
.
AGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAG
AAAGAAGAAGAAGAAAAGAAG,A
128419.64
11
131789533
.
GAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
GAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA,G
174925.51
11
131789534
.
AAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAG
AAAGAAGAAG,GAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAG,A
128965.63
11
131789535
.
AGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAG
A,AAAGAAG,AAAGAAGAAG,AAAG
131781.15
11
131789537
.
AAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAG
A,AAAG
131566.27
11
131789540
rs868470704
AAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAG
AAAGAAGAAGAAG,AAAGAAG,AAAG,A,AAAGAAGAAG
137487.23
11
131789542
.
GAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGA
GAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGA,GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGA,G
148961.03
11
131789543
.
AAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAG
A,AAAG,AAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAG,AAAGAAGAAGAAGAAG
141238.48
11
131789546
.
AAAAGAAGAAGAAGAAGAAG
AGAAAGAAGAAGAAGAAGAAG,AAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAGAAGAAGAAGAAGAAG,A,AAAGAAGAAG
152513.85
11
131789550
rs199625984
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
G,GGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
193913.73
11
131789551
.
A
G
213463.11
11
131789552
.
A
G
225438.43
11
131789553
.
G
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGA
204858.46
11
131789554
.
AAGAAGAAGAAGAAGAAG
A,AAAGAAGAAG
170912.36
11
131789555
.
AGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAG
AAAGAAGAAG,GGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAG,AAAGAAGAAGAAG,A,AAAG
146745.86
11
131789556
.
G
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGA
145047.88
11
131789557
.
AAGAAGAAGAAGAAGAAG
GAGAAGAAGAAGAAGAAG,A
134189.81
11
131789558
.
AGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAG
A,GGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAG
117899.94
11
131789559
.
G
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGA
143445.56
11
131789560
.
A
G
96204.74
11
131789561
.
A
G,AGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAG
128024.29
11
131789562
.
G
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGA,GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGA
93082.01
11
131789563
.
A
G
72831.06
11
131789564
rs545868392
A
G
72652.50
11
131789566
.
A
G
56778.15
11
131789567
.
A
G
74642.09
11
131789568
.
GA
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA,G
61054.78
11
131789569
.
A
G
56531.86
11
131789570
.
AGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAG
A,GGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAG
52161.86
11
131789571
.
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
G,GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA,GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
71055.22
11
131789572
.
A
G
47326.63
11
131789574
.
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA,G
49318.24
11
131789575
.
A
G
46868.67
11
131789576
.
A
G
41812.77
11
131789578
.
A
G
42134.80
11
131789581
.
A
G
42232.67
11
131789582
.
AGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAG
AAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAG,AAGCATGGGCCGGGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAG,A
41361.46
11
131789584
.
A
G,AAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGGAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGGAGAAGAAGG
44648.41
11
131789585
.
AGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAG
A
40504.22
11
131789586
.
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
G,GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
41534.55
11
131789587
.
A
G
39102.67
11
131789589
.
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
G
38262.39
11
131789590
.
A
G
43598.32
11
131789591
.
AGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAG
AAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAG,A
36844.31
11
131789592
.
G
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAA
41898.28
11
131789593
.
A
G
42749.39
11
131789594
.
AG
A
38218.91
11
131789595
.
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
G,GAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA,GAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
35106.87
11
131789596
.
A
G
44826.15
11
131789597
.
AGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAG
A
34324.09
11
131789598
.
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
G,GAAGAAGAAAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
36753.42
11
131789599
.
A
G,AAGG,AAGGAGAAGG
39709.30
11
131789600
.
A
G,AG
40200.77
11
131789601
.
G
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAA,GAA
35331.03
11
131789602
rs557994010
A
AAGG,G,AAGGAGAAGG,AAGGAGAAGGAGAAGG,AAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGG
46003.17
11
131789603
.
A
G,AG
38828.34
11
131789604
.
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
G
124128.85
11
131789605
.
A
AAGG,G,AGAAGGAGAAGG,AAGGAGAAGG
142201.54
11
131789606
.
A
G,AG
123414.15
11
131789607
.
G
GAAA
122700.26
11
131789608
.
A
G,AAGG,AAGGAGAAGG,AAGGAGAAGGAGAAGG,AGAAGG
136083.19
11
131789610
.
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
G
121970.71
11
131789611
rs867024939
A
G,AAGG,AAGGAGAAGG
135095.55
11
131789612
.
A
G,AGAT
122150.87
11
131789613
.
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
G,GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA,AAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA,GAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA,GAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
126525.11
11
131789614
rs867600201
A
G,AAGG,AAGGAGG
140830.54
11
131789615
.
AG
A
128570.41
11
131789616
rs552548729
GA
AA,G
127250.44
11
131789617
rs542958417
AAG
GAG,AAGGAG,A,AAGAAGGAG,AAGAAGAAGGAG
138572.88
11
131789618
.
A
G
123128.49
11
131789619
.
GAAGAAGAAGAAGAAGAA
AAAGAAGAAGAAGAAGAA,G,GA,GAGAAGAAGAAGAAGAA
130312.36
11
131789620
.
AAGAAGAAGAAGAAG
GAGAAGAAGAAGAAG,A,AAGGAGAAGAAGAAGAAG
153097.16
11
131789621
.
A
G
124235.27
11
131789622
.
GAAGAAGAAGAAGAA
AAAGAAGAAGAAGAA,GAAAGAAGAAGAAGAA,G,GAGAAGAAGAAGAA
129611.98
11
131789623
rs866916609
AAGAAGAAGAAG
GAGAAGAAGAAG,A,AAGGAGAAGAAGAAG
128162.16
11
131789625
.
GAAGAAGAAGAA
G,AAAGAAGAAGAA,GGAA,GAGAAGAAGAA
130515.43
11
131789626
rs866408135
AAGAAGAAG
GAGAAGAAG,A,AAAGAAG,AAGGAGAAGAAG
158923.91
11
131789627
.
A
G,AGAG
129396.47
11
131789628
.
GAAGAAGAA
AAAGAAGAA,GAAAGAAGAA,G,GAGAAGAA
133497.70
11
131789629
.
AAGAAGAAAAGAAGAAG
GAGAAGAAAAGAAGAAG,A,AAAGAAAAGAAGAAG,AAGGAGAAGAAAAGAAGAAG,AAGAAGAAGGAGAAGAAAAGAAGAAG
132855.36
11
131789630
rs866880594
A
G
130860.65
11
131789631
.
GAAGAAA
GAGAAA,G,GA,GGAAA
140881.55
11
131789632
.
AAGAAAAGAAGAAG
GAGAAAAGAAGAAG,A
165820.24
11
131789633
.
A
G,AG
133920.78
11
131789634
rs868448347
GAAA
GA,G,GAA
263298.19
11
131789635
.
AAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAG
AAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAG,AAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAG,AGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAG,A,AAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAG
265804.98
Mapping repeat track to Kaviar: |
---|
Chr
Pos
dbSNP_ID
Ref
Alt
Qual
11
131789547
rs71067336
AAAGAAGAAGAAGAAG
A
.
11
131789550
rs199625984
G
A
.
11
131789551
.
A
G
.
11
131789557
.
A
G
.
11
131789558
.
A
AG
.
11
131789563
.
A
G
.
11
131789564
rs545868392
A
G
.
11
131789566
.
A
G
.
11
131789569
.
A
G
.
11
131789575
.
A
G
.
11
131789579
.
A
G
.
11
131789584
.
A
G
.
11
131789588
.
A
G
.
11
131789589
.
G
A
.
11
131789592
.
G
A
.
11
131789594
.
A
G
.
11
131789596
.
A
G
.
11
131789598
.
G
GA
.
11
131789599
.
A
G
.
11
131789600
.
A
G
.
11
131789600
.
A
AG
.
11
131789602
rs557994010
A
G
.
11
131789605
.
A
G
.
11
131789606
.
AG
A
.
11
131789608
.
A
G
.
11
131789611
.
A
G
.
11
131789614
.
A
G
.
11
131789615
.
A
G
.
11
131789616
rs552548729
G
GA
.
11
131789617
rs542958417
A
G
.
11
131789620
.
A
G
.
11
131789621
.
A
G
.
11
131789623
.
A
G
.
11
131789627
.
A
G
.
11
131789628
.
G
GA
.
11
131789629
.
A
G
.
11
131789630
.
A
G
.
11
131789631
.
G
A
.
11
131789632
.
A
G
.
11
131789633
.
A
G
.
11
131789633
.
A
AG
.
11
131789634
.
G
A
.
11
131789634
rs749417794
GAA
G
.
11
131789636
rs140094444
A
G
.
11
131789636
rs374898394
A
AG
.