| General information of RDP00563 | |
|---|---|
| Gene Symbol: | NTM |
| RefSeq ID: | NM_001048209 |
| Repeat coordinate: | chr11:131789429-131789489 (+) |
| Repeat size: | 20 |
| Repeat region: | intron |
| Repeat unit: | GAA |
| Repeat conservation: | PhastCons_score: 0.000; Repeat Conservation from UCSC Genome Browser |
| Amino acid sequence: | - |
| Gene expression and GO annotation: | BioGPS |
| Protein expression: | Human Protein Altas |
| Gene conservation: | Gene Conservation from UCSC Genome Browser |
| Mapping repeat track to DisGeNET: | |||||
|---|---|---|---|---|---|
| Disease_name | RefSeq | Score | NofPmids | NofSnps | Source |
| Major Depressive Disorder | NM_001048209 | 0.31 | 1 | 0 | PSYGENET |
| Mapping repeat track to gnomAD: |
|---|
Chr
Pos
dbSNP_ID
Ref
Alt
Qual
11
131789412
.
AAAGAAAAAAAGAAGAAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAG
A
872.91
11
131789416
.
AAAAAAAGAAGAAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAG
A
873.94
11
131789418
.
AAAAAGAAGAAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAG
A,GAAAAGAAGAAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAG
22271.14
11
131789419
.
AAAAGAAGAAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAG
A,AGAAGAAGAAAGAAGAAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAG,AGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAG,AAGAAAGAAGAAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAG
56935.98
11
131789420
rs774212449
AAAGAAGAAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAG
AGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAG,GAAGAAGAAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAG,AGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAG,A,AAAGAAGAAG
22326.48
11
131789421
rs765737941
AAGAAGAAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAG
AAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAG,AAAGAAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAG,AAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAG,A
27626.05
11
131789422
.
AGAAGAAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGG
AAAGAAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGG,A,AGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGGAAGAAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGG,AGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGGAAGAAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGG
42651.80
11
131789423
rs200425976
GAAGAAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGA
GAAAGAAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGA,AAAGAAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGA,G
113330.71
11
131789424
rs532434495
AAGAAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAG
AAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAG,A,AAAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAG
104664.01
11
131789426
rs200240416
GAAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
GAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA,G,GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
194503.35
11
131789429
rs199925007
GGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA,GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA,GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA,GGAAGAA,G
544153.78
11
131789430
.
G
A
285739.26
11
131789433
.
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGA
G
129740.87
11
131789435
rs867319825
A
G
104239.82
11
131789436
.
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGA
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGA,G
167092.88
11
131789439
.
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGA
G
100153.52
11
131789440
rs189759361
A
G
105176.17
11
131789441
.
A
G
72163.33
11
131789442
.
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA,G
144911.78
11
131789445
.
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
G,GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
103290.65
11
131789446
.
AAG
GAG,A
125579.97
11
131789447
rs182791319
A
G
106242.46
11
131789448
.
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
G,GGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA,GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
165066.97
11
131789449
rs556987453
A
G
108712.96
11
131789451
.
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
G,GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
127580.58
11
131789452
.
AAG
A
126508.11
11
131789453
rs185657984
A
G,AGAAG
130692.37
11
131789454
.
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA,G,GGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA,GGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
156182.42
11
131789455
.
AAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAG
GAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAG,A
114829.55
11
131789456
.
AGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAG
A
85999.32
11
131789457
.
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA,G,GGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
136395.28
11
131789458
.
AAG
A
136129.56
11
131789459
.
AGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAG
GGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAG,A
119713.38
11
131789460
.
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA,G,GAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA,GAAGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
178590.25
11
131789461
.
AAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAG
GAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAG,AAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAG,A,AAAG,AAAGAAGAAGAAG
88073.87
11
131789462
.
AGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAG
A
95687.11
11
131789463
.
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGA
GAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGA,G,GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGA
187500.82
11
131789464
.
AAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAG
AAAG,AAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAG,AAAGAAG,AAAGAAGAAGAAG,A
131932.71
11
131789465
.
AGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAG
A,GGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAG
213978.84
11
131789466
.
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
GGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA,GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA,GAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA,G
139941.11
11
131789467
.
AAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAG
AAAGAAGAAGAAG,AAAGAAG,AAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAG,AAAG,A
155215.16
11
131789468
.
AGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAG
A,AGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAG
197123.20
11
131789469
.
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
GAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA,GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA,G,GGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA,GAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
168434.76
11
131789470
.
AAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAG
A,AAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAG,AAAG,AAAGAAGAAGAAG,AAAGAAGAAG
222107.90
11
131789471
.
AGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAG
A,GGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAG,AGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAG
327270.66
11
131789472
.
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGA
GAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGA,GAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGA,GGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGA,G
251262.93
11
131789473
rs758451362
AAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAG
AAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAG,AAAGAAG,A,AAAGAAGAAG,AAAG
274422.93
11
131789474
.
AGAAGAAGAAGAAGAAGAG
A,AGGAAGAAGAAGAAGAAGAG
377936.09
11
131789475
.
GAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAA
GAAAGAAGAAGAA,GAAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAA,GGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAA,G
306568
11
131789476
rs866434183
AAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAG
AAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAG,A,AAAG,AAAGAAG,AAAGAAGAAG
335267.40
11
131789477
.
AGAAGAAGAAGAAGAG
A,GGAAGAAGAAGAAGAG,AGGAAGAAGAAGAAGAG
432449.12
11
131789478
.
GAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
GGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA,GGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA,GA,G
360653.32
11
131789479
.
AAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAG
AAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAG,AAAG,AAAGAAGAAG,A,AAAGAAG
376902.28
11
131789480
rs866603015
AGAAGAAGAAGAG
A,AGGAAGAAGAAGAG
472272.05
11
131789481
.
GAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGA
GAAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGA,G,GGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGA,GGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGA
396233.31
11
131789482
rs868562827
AAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAG
AAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAG,AAAGAAG,A,AAAG,AAAGAAGAAG
400071.57
11
131789483
.
AGAAGAAGAG
A,AGGAAGAAGAG
478908.50
11
131789484
rs746754202
GAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGA
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGA,G,GGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGA,GGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGA
423055.30
11
131789485
.
AAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAG
AAAAGAAGAAGAAGAAG,AAAGAAG,AAAGAAGAAGAAG,AAAGAAGAAG,A
427536.30
11
131789486
rs200573479
AGAAGAG
A,AGGAAGAG
506721.23
11
131789487
.
GAAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
G,GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA,GAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA,GGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA,GGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
451454.12
11
131789488
rs866013652
AAGAGGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAG
AAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAG,AAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAG,AAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAG,A,AAAGAAG
454772.95
11
131789489
rs575459869
AGAG
A,AAG
561838.88
| Mapping repeat track to Kaviar: |
|---|
Chr
Pos
dbSNP_ID
Ref
Alt
Qual
11
131789420
rs201087352
AAAGAAGAAGG
A
.
11
131789421
rs765737941
AAGAAGAAGG
A
.
11
131789424
rs746226470
AAGAAGG
A
.
11
131789425
rs747774029
AGAAGG
A
.
11
131789430
.
G
A
.
11
131789432
rs374083195
A
G
.
11
131789432
rs202152390
A
AGAG
.
11
131789434
rs567984082
A
G
.
11
131789435
.
A
G
.
11
131789440
rs189759361
A
G
.
11
131789441
.
A
G
.
11
131789444
.
A
G
.
11
131789445
.
G
GA
.
11
131789447
rs182791319
A
G
.
11
131789449
rs556987453
A
G
.
11
131789453
rs185657984
A
G
.
11
131789453
.
A
AG
.
11
131789456
.
A
G
.
11
131789456
.
A
AG
.
11
131789459
.
A
AG
.
11
131789460
.
G
GA
.
11
131789460
.
GAA
G
.
11
131789461
.
A
G
.
11
131789462
.
A
G
.
11
131789462
.
A
AG
.
11
131789463
.
G
GA
.
11
131789464
.
A
G
.
11
131789465
.
A
AG
.
11
131789466
.
G
GA
.
11
131789467
.
A
G
.
11
131789467
.
AAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAG
A
.
11
131789467
.
AAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAG
A
.
11
131789468
.
A
G
.
11
131789468
.
A
AG
.
11
131789469
.
G
GA
.
11
131789469
.
GAA
G
.
11
131789470
.
A
G
.
11
131789471
.
A
AG
.
11
131789471
.
AG
A
.
11
131789472
.
G
GA
.
11
131789473
.
A
G
.
11
131789473
rs758451362
AAG
A
.
11
131789474
.
A
G
.
11
131789474
.
A
AG
.
11
131789475
.
G
GA
.
11
131789477
.
A
AG
.
11
131789478
.
G
GA
.
11
131789479
.
A
G
.
11
131789480
.
A
AG
.
11
131789480
.
AG
A
.
11
131789481
.
G
GA
.
11
131789482
.
A
G
.
11
131789483
.
A
AG
.
11
131789484
.
G
GA
.
11
131789484
rs746754202
GAA
G
.
11
131789485
.
A
G
.
11
131789486
rs200573479
A
G
.
11
131789486
rs200085208
A
AGAG,AG
.
11
131789489
rs575459869
A
G
.