| General information of RDP00491 | |
|---|---|
| Gene Symbol: | RGPD1 |
| RefSeq ID: | NM_001024457 |
| Repeat coordinate: | chr2:87825417-87825441 (-) |
| Repeat size: | 8 |
| Repeat region: | intron |
| Repeat unit: | CGG |
| Repeat conservation: | PhastCons_score: 0.001; Repeat Conservation from UCSC Genome Browser |
| Amino acid sequence: | - |
| Gene expression and GO annotation: | BioGPS |
| Protein expression: | Human Protein Altas |
| Gene conservation: | Gene Conservation from UCSC Genome Browser |
| Mapping repeat track to gnomAD: |
|---|
Chr
Pos
dbSNP_ID
Ref
Alt
Qual
2
87825373
.
GGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCCGGCCAGGCCGAGGCCGAGGCC
GGCCGCCGCCGCCGCCGCCCGGCCAGGCCGAGGCCGAGGCC,GGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCCGGCCAGGCCGAGGCCGAGGCC,GGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCCGGCCAGGCCGAGGCCGAGGCC,G,GGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCCGGCCAGGCCGAGGCCGAGGCC
171428.04
2
87825384
.
CCGCCGCCGCCGCCCGGCCAGGCCGAGGCCGAGGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCCGGCCAGGCCGAGGCCGAGGCCGAGGCCGCCGTCGCCGCCGCCGCCGCCCGGCCGAGGCCGA
C
86942.47
2
87825402
.
CAGGCCGAGGCCGAGGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCCGGCCAGGCCGAGGCCG
CAGGCCG,C,CAGGCCGAGGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCCGGCCAGGCCGAGGCCG
256353.22
2
87825416
.
GGCCGCCGCCGCC
GGCCGCCGCCGCCGCC,GGCCGCCGCC,GGCCGCCGCCGCCGCCGCC,G,GGCCGCC
248988.44
2
87825417
.
GCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCCGGCCAGGCCGAGGCCGAGGCCGAGGCCGCCGTCGCCGCCGCCGCCGCCCGGCCGAGGCCGAGGCCGAGGCCGCCGC
G
193077.71
2
87825418
.
CCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCCGGCCAGGCCGAGGCCGAGGCCGAGGCCGCCGT
CCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCCGGCCAGGCCGAGGCCGAGGCCGAGGCCGCCGTCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCCGGCCAGGCCGAGGCCGAGGCCGAGGCCGCCGT,C
199877.67
2
87825419
.
C
CGAG
194043.21
2
87825420
.
G
A
175594.38
2
87825421
.
C
A
174937.36
2
87825422
.
C
G
170370.79
2
87825424
rs867502175
C
CCGT,T
200624.34
2
87825425
.
CGCCGCCGCCGCCGCCGCCCGGCCAGGCCGAGGCCGAGGCCGAGGCCGCCGTCGCCGCCGCCGCCGCCCGGCCGAGGCCGAGGCCGAG
C
170285.09
2
87825427
.
CCGCCGCCGCCGCCGCCCGGCCAGGCCGAGGCCGAGGCCGAGGCCGCCGT
TCGCCGCCGCCGCCGCCCGGCCAGGCCGAGGCCGAGGCCGAGGCCGCCGT,C
186983.25
2
87825430
.
CCGCCGCCGCCGCCCGGCCAGGCCGAGGCCGAGGCCGAGGCCGCCGT
TCGCCGCCGCCGCCCGGCCAGGCCGAGGCCGAGGCCGAGGCCGCCGT,C
171503.15
2
87825433
.
C
A
166820.26
2
87825434
.
CGCCGCCGCCCGGCCAGGCCGAGGCCGAGGCCGAGGCCGCCGTCGCCGCCGCCGCCGCCCGGCCGAGGCCGAGGCCGAGGCCGCCGCCCGGCCGAGGCCGAGGCCGAGGCCGCCGCCCGGCCAGGTCGAG
CGCCGCCGCCCGGCCGAGGCCGAGGCCGAGGCCGCCGCCCGGCCAGGTCGAG,C
167697.98
2
87825437
.
CGCCGCCCGGCCAGGCCGAGGCCGAGGCCGAG
C,CCCGCCCGGCCAGGCCGAGGCCGAGGCCGAG
186906.57
2
87825438
rs866468258
G
A
192640.70
2
87825439
.
CCGCCCGGCCA
C
181523.11
2
87825440
.
CGCCCGGCCAGGCCGAGGCCGAGGCCGAG
CCCCGGCCAGGCCGAGGCCGAGGCCGAG,C
199482.64
2
87825441
.
GC
G
198313
| Mapping repeat track to Kaviar: |
|---|
Chr
Pos
dbSNP_ID
Ref
Alt
Qual
2
87825424
.
C
T
.
2
87825439
.
CCG
C
.