General information of RDP00428
Gene Symbol:EIF4G3
RefSeq ID:NM_001198801
Repeat coordinate:chr1:21176569-21176590 (-)
Repeat size:7
Repeat region:intron
Repeat unit:CGG
Repeat conservation:PhastCons_score: 0.998; Repeat Conservation from UCSC Genome Browser
Amino acid sequence:-
Gene expression and GO annotation: BioGPS
Protein expression:Human Protein Altas
Gene conservation:Gene Conservation from UCSC Genome Browser
Mapping repeat track to gnomAD:
Chr
Pos
dbSNP_ID
Ref
Alt
Qual
1
21176563
.
CCCGACGCCG
C,CCCGACGCCGACGCCG
550.38
1
21176567
.
ACGCCGCCGCCGCCGCCGC
ACGCCGCCGCCGCCGCCGCCGC,ACGCCGCCGC,ACGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGC,A,ACGCCGCCGCCGCCGC
51743.79
1
21176569
.
GCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCT
G
21135.99
1
21176572
.
GCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCT
G
25155.73
1
21176574
.
CGCCGCCGCCGCCGCCGCCTCCGCCGCCGCCGCCGCCGGCAGCAGCA
C
23768.84
1
21176575
.
GCCGCCGCCGCCGCCGCCT
G
87619.84
1
21176577
.
CGCCGCCGCCGCCGCCTCCGCCGCCGCCGCCGCCGGCAGCAGCA
C
82092.34
1
21176578
.
GCCGCCGCCGCCGCCT
GCCGCCGCCGCCGCCTCCGCCGCCGCCGCCT,G,TCCGCCGCCGCCGCCT,GCCGCCGCCTCCGCCGCCGCCGCCT
116893.55
1
21176580
.
CGCCGCCGCCGCCTCCGCCGCCGCCGCCGCCGGCAGCAGCA
C
88286.58
1
21176581
.
GCCGCCGCCGCCT
G
89072.82
1
21176584
.
GCCGCCGCCT
G
89513.24
1
21176586
.
C
G
84271.41
1
21176587
.
GCCGCCT
G
84435.57
Mapping repeat track to Kaviar:
Chr
Pos
dbSNP_ID
Ref
Alt
Qual
1
21176567
.
ACGCCGCCGC
A
.
1
21176572
.
GCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCT
G
.
1
21176575
.
GCCGCCGCCGCCGCCGCCT
G
.
1
21176578
.
G
GCCGCCGCCGCCGCCT
.
1
21176581
.
G
C
.
1
21176589
.
C
T
.