General information of RDP00391
Gene Symbol:SUPT20HL1
RefSeq ID:NM_001136234
Repeat coordinate:chrX:24364258-24364309 (+)
Repeat size:17
Repeat region:CDS
Repeat unit:CTG
Repeat conservation:PhastCons_score: 0.000; Repeat Conservation from UCSC Genome Browser
Amino acid sequence:AAAAAAAAAAAAAAAA
Gene expression and GO annotation: BioGPS
Protein expression:Human Protein Altas
Gene conservation:Gene Conservation from UCSC Genome Browser
Mapping repeat track to ESP:
Chr
Pos
dbSNP_ID
Ref
Alt
Qual
X
24364309
~rs35206911
GCTC
G
.
Mapping repeat track to ExAC:
Chr
Pos
dbSNP_ID
Ref
Alt
Qual
X
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rs772857345
TCTGCTGCTGCTGCTATTGCTGCTGCTGCTGCTG
CCTGCTGCTGCTGCTATTGCTGCTGCTGCTGCTG,T,TCTG
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X
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C
T
30619442.77
X
24364261
.
G
T
23675849.18
X
24364262
.
C
T
23693510.19
X
24364263
.
T
A
10790345.35
X
24364264
.
G
A
10781629.97
X
24364265
.
C
T
10781589.88
X
24364266
.
T
A
6687295.22
X
24364267
.
G
A
6687092.24
X
24364271
.
C
CTGT
4001741.10
X
24364272
rs750621201
TG
T
2266890.68
X
24364274
.
CTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTCCTGCTCCTGCTCTAGCTGCTGCTG
C
2258898.90
X
24364275
.
TG
T
1288105.34
X
24364276
rs779993614
G
C
1289711.88
X
24364277
.
CTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTCCTGCTCCTGCTCTAGCTGCTGCTG
C
1286966.62
X
24364282
.
G
GCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTC,C
401918.71
X
24364283
.
C
CTAT
401927.27
X
24364284
.
TG
T
149623.77
X
24364285
rs747610071
G
C
156324.67
X
24364286
.
CTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTCCTGCTCCTGCTCTAGCTGCTGCTG
C
150401.42
X
24364287
.
TG
T
101915.03
X
24364288
rs770679887
G
C
102467.88
X
24364289
.
CTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTCCTGCTCCTGCTCTAGCTGCTGCTG
C
101500.52
X
24364290
.
TG
T,TGCTGCTGCTGCTGCCG
104294.76
X
24364291
rs776061720
G
C
107262.76
X
24364292
.
CTGCTGCTGCTGCTGCTGCTCCTGCTCCTGCTCTAGCTGCTGCTG
C
101881.77
X
24364293
.
TGC
TC,T
117628.27
X
24364294
rs199682391
G
C
118899.41
X
24364295
rs770757321
CTGCTGCTGCTGCTGCTCCTGCTCCTGCTCTAGCTGCTGCTG
C
113703.43
X
24364296
.
TGCTGCTGCTG
TCTGCTGCTG,T
117311.63
X
24364297
rs867845567
G
C
108355.67
X
24364298
.
CTGCTGCTGCTGCTCCTGCTCCTGCTCTAGCTGCTGCTG
C
104808.93
X
24364299
.
TGCTGCTGCTGCTCCTGCTCCTGCTCTAGCTGCTGCTGCTGCTCCTGCTCTA
TCTGCTGCTGCTCCTGCTCCTGCTCTAGCTGCTGCTGCTGCTCCTGCTCTA,TGCTGCTGCTGCTCCTGCTCCTGCTCTAGCTGCTGCTGCTCCTGCTCCTGCTCTAGCTGCTGCTGCTGCTCCTGCTCTA,CGCTGCTGCTGCTCCTGCTCCTGCTCTAGCTGCTGCTGCTGCTCCTGCTCTA,T
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X
24364300
rs185449787
GCTGCTGCTGCTCCTGCTC
CCTGCTGCTGCTCCTGCTC,GCTGCTGCTGCTCCTGCTGCTGCTCCTGCTC,GCTGCTGCTGCTGCTCCTGCTGCTGCTCCTGCTC,G
581499.08
X
24364301
.
CTGCTGCTGCTCCTGCTCCTGCTCTAGCTGCTGCTGCTGCTCCTGCTCTAGCTGCTGCTG
CCTGCTCCTGCTCTAGCTGCTGCTG,C
278839.19
X
24364302
rs745534241
TG
T,TGCTGCTGCTCCTGCTCCTGCTCTAG,TGCTGCTGCTGCTCCTGCTCCTGCTCTAG
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X
24364303
rs868346878
G
GCTGCTC
312664.60
X
24364304
.
CTGCTGCTCCTGCTCCTGCTCTAGCTGCTGCTG
C
305353.99
X
24364305
rs775015453
TGCTGCTCCTGCTCCTGCTCTA
TCTGCTCCTGCTCCTGCTCTA,T
347406.03
X
24364306
rs764559977
GCTGCTC
GCTCCTGCTC,G,GCTGCTCCTGCTC,ACTGCTC
392152.57
X
24364307
.
CTGCTCCTGCTCCTGCTCTAGCTGCTGCTG
C
340884.29
X
24364308
rs774915478
TGCTCCTGCTCCTGCTCTA
TCTCCTGCTCCTGCTCTA,T
1762409.83
X
24364309
rs867801270
GCTC
G,ACTC
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Mapping repeat track to gnomAD:
Chr
Pos
dbSNP_ID
Ref
Alt
Qual
X
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TTGCTGCTGCTGCTGCTGC,TTGCTGCTGCTGC,TTGCTGCTGCTGCTGC,TTGCTGC,T,TTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGC
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X
24364262
.
C
CCCTCTG
479853.70
X
24364265
.
C
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343069.36
X
24364277
.
CTG
C
40317.65
X
24364280
rs2525863
CT
C
27696.42
X
24364281
.
TG
T
24707.71
X
24364282
.
G
GCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTC
25983.86
X
24364287
.
TG
T
5516.89
X
24364289
.
CTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTCCTGCTCCTGCTCTAGCTGCTGCTG
C
5453.19
X
24364290
.
TG
T
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X
24364291
rs776061720
GCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTC
G
8976.18
X
24364292
.
CTGCTGCTGCTGCTGCTGCTCCTGCTCCTGCTCTAGCTGCTGCTG
C
8876.54
X
24364293
.
TGC
TC,T
13725.11
X
24364295
rs770757321
CTGCTGCTGCTGCTGCTCCTGCTCCTGCTCTAGCTGCTGCTG
C
13406.13
X
24364296
.
TGCTGCTGCTG
TCTGCTGCTG,T
13803.28
X
24364298
.
CTGCTGCTGCTGCTCCTGCTCCTGCTCTAGCTGCTGCTG
C
13723.20
X
24364299
.
TG
T
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X
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GCTGCTGCTGCTC
GCTGCTGCTGCTCCTGCTGCTGCTC,G
100742.20
X
24364301
.
CTGCTGCTGCTCCTGCTCCTGCTCTAGCTGCTGCTGCTGCTCCTGCTCTAGCTGCTGCTG
CCTGCTCCTGCTCTAGCTGCTGCTG,C
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X
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rs745534241
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TCTGCTGCTCCTGCTCCTGCTCTA,T
101262.71
X
24364304
.
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C
100668.48
X
24364305
rs775015453
TGCTGCTCCTGCTCCTGCTCTA
TCTGCTCCTGCTCCTGCTCTA,T
112344.20
X
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rs764559977
GCTGCTC
GCTCCTGCTC,G
114738.55
X
24364307
.
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C
112933.69
X
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rs774915478
TGCTCCTGCTCCTGCTCTA
T,TCTCCTGCTCCTGCTCTA
288294.85
X
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GCTC
G
396644.11
Mapping repeat track to Kaviar:
Chr
Pos
dbSNP_ID
Ref
Alt
Qual
X
24363270
.
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G
.
X
24363270
.
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G
.
X
24363270
.
GATGCAGACTTTAGCCCATGATGTGAAGATGATGACAAGAGATGGCCAGAAATGGAGCCAGGAAGACAAGCTTCAGCTTGAGAGCCAGCTGATCTTAGCGACAGCTGAACCACTGTGTCTTGATCCTTCTGTAGCAGTTGCCTGCACTGCAAACAGGCTGCTGTACAACAAGCAAAAGATGAATACCGACCCGATGAAACGGTGCCTCCAGAGGTATTCGTGGCCCTCTGTAAAGCCACAGCAGGAGCAGTCTGACTGTCCACCTCCTCCTGAGCTGAGAGTGTCGACTTCTGGCCAAAAAGAAGAAAGAAAAGTAGGTCAGCCTTGTGAGCTGAACATTGCTAAAGCAGGAAGTTGTGTAGACACGTGGAAAGGCAGACCCTGTGATTTGGCCGTGCCTTCAGAAGTGGATGTGGAGAAACTTGCTAAAGGGTATCAGTCCGTCACAGCTGCTGACCCACAGCTCCCAGTCTGGCCAGCCCAGGAGGTAGAAGACCCTTTTGGATTTGCGTTGGAAGCTGGCTGTCAGGCCTGGGACACCAAGCCAAGCATCATGCAGTCGTTTAATGATCCGCTTCTCTGTGGTAAAATACGGCCACGTAAAAAAGCCAGGCAGAAGAGCCAGAAGTCTCCCTGGCAGCCCTTCCCAGATGACCATTCAGCTTGTCTCAGGCCTGGGTCAGAGACTGATGCTGGGAGGGCAGTGAGTCAGGCCCAGGAATCGGTGCAGAGCAAAGTCAAAGGTCCAGGCAAGATGTCACACAGCTCCAGTGGCCCAGCCAGTGTCAGTCAGCTCTCTTCATGGAAAACACCAGAACAGCCTGATCCTGTGTGGGTCCAGTCTTCAGTATCGGGGAAGGGAGAGAAACATCCACCTCCCCGCACCCAACTTCCCTCAAGCTCAGGAAAGATTTCCTCAGGTAACAGTTTTCCCCCACAACAGGCAGGCAGCCCTCTTAAGCGTCCATTTTCTGCTGCTGCTGCTATTGCTGCTGC
G
.
X
24363270
.
GATGCAGACTTTAGCCCATGATGTGAAGATGATGACAAGAGATGGCCAGAAATGGAGCCAGGAAGACAAGCTTCAGCTTGAGAGCCAGCTGATCTTAGCGACAGCTGAACCACTGTGTCTTGATCCTTCTGTAGCAGTTGCCTGCACTGCAAACAGGCTGCTGTACAACAAGCAAAAGATGAATACCGACCCGATGAAACGGTGCCTCCAGAGGTATTCGTGGCCCTCTGTAAAGCCACAGCAGGAGCAGTCTGACTGTCCACCTCCTCCTGAGCTGAGAGTGTCGACTTCTGGCCAAAAAGAAGAAAGAAAAGTAGGTCAGCCTTGTGAGCTGAACATTGCTAAAGCAGGAAGTTGTGTAGACACGTGGAAAGGCAGACCCTGTGATTTGGCCGTGCCTTCAGAAGTGGATGTGGAGAAACTTGCTAAAGGGTATCAGTCCGTCACAGCTGCTGACCCACAGCTCCCAGTCTGGCCAGCCCAGGAGGTAGAAGACCCTTTTGGATTTGCGTTGGAAGCTGGCTGTCAGGCCTGGGACACCAAGCCAAGCATCATGCAGTCGTTTAATGATCCGCTTCTCTGTGGTAAAATACGGCCACGTAAAAAAGCCAGGCAGAAGAGCCAGAAGTCTCCCTGGCAGCCCTTCCCAGATGACCATTCAGCTTGTCTCAGGCCTGGGTCAGAGACTGATGCTGGGAGGGCAGTGAGTCAGGCCCAGGAATCGGTGCAGAGCAAAGTCAAAGGTCCAGGCAAGATGTCACACAGCTCCAGTGGCCCAGCCAGTGTCAGTCAGCTCTCTTCATGGAAAACACCAGAACAGCCTGATCCTGTGTGGGTCCAGTCTTCAGTATCGGGGAAGGGAGAGAAACATCCACCTCCCCGCACCCAACTTCCCTCAAGCTCAGGAAAGATTTCCTCAGGTAACAGTTTTCCCCCACAACAGGCAGGCAGCCCTCTTAAGCGTCCATTTTCTGCTGCTGCTGCTATTGCTGCTGCT
G
.
X
24363270
.
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G
.
X
24363270
.
GATGCAGACTTTAGCCCATGATGTGAAGATGATGACAAGAGATGGCCAGAAATGGAGCCAGGAAGACAAGCTTCAGCTTGAGAGCCAGCTGATCTTAGCGACAGCTGAACCACTGTGTCTTGATCCTTCTGTAGCAGTTGCCTGCACTGCAAACAGGCTGCTGTACAACAAGCAAAAGATGAATACCGACCCGATGAAACGGTGCCTCCAGAGGTATTCGTGGCCCTCTGTAAAGCCACAGCAGGAGCAGTCTGACTGTCCACCTCCTCCTGAGCTGAGAGTGTCGACTTCTGGCCAAAAAGAAGAAAGAAAAGTAGGTCAGCCTTGTGAGCTGAACATTGCTAAAGCAGGAAGTTGTGTAGACACGTGGAAAGGCAGACCCTGTGATTTGGCCGTGCCTTCAGAAGTGGATGTGGAGAAACTTGCTAAAGGGTATCAGTCCGTCACAGCTGCTGACCCACAGCTCCCAGTCTGGCCAGCCCAGGAGGTAGAAGACCCTTTTGGATTTGCGTTGGAAGCTGGCTGTCAGGCCTGGGACACCAAGCCAAGCATCATGCAGTCGTTTAATGATCCGCTTCTCTGTGGTAAAATACGGCCACGTAAAAAAGCCAGGCAGAAGAGCCAGAAGTCTCCCTGGCAGCCCTTCCCAGATGACCATTCAGCTTGTCTCAGGCCTGGGTCAGAGACTGATGCTGGGAGGGCAGTGAGTCAGGCCCAGGAATCGGTGCAGAGCAAAGTCAAAGGTCCAGGCAAGATGTCACACAGCTCCAGTGGCCCAGCCAGTGTCAGTCAGCTCTCTTCATGGAAAACACCAGAACAGCCTGATCCTGTGTGGGTCCAGTCTTCAGTATCGGGGAAGGGAGAGAAACATCCACCTCCCCGCACCCAACTTCCCTCAAGCTCAGGAAAGATTTCCTCAGGTAACAGTTTTCCCCCACAACAGGCAGGCAGCCCTCTTAAGCGTCCATTTTCTGCTGCTGCTGCTATTGCTGCTGCTGCTGCT
G
.
X
24363270
.
GATGCAGACTTTAGCCCATGATGTGAAGATGATGACAAGAGATGGCCAGAAATGGAGCCAGGAAGACAAGCTTCAGCTTGAGAGCCAGCTGATCTTAGCGACAGCTGAACCACTGTGTCTTGATCCTTCTGTAGCAGTTGCCTGCACTGCAAACAGGCTGCTGTACAACAAGCAAAAGATGAATACCGACCCGATGAAACGGTGCCTCCAGAGGTATTCGTGGCCCTCTGTAAAGCCACAGCAGGAGCAGTCTGACTGTCCACCTCCTCCTGAGCTGAGAGTGTCGACTTCTGGCCAAAAAGAAGAAAGAAAAGTAGGTCAGCCTTGTGAGCTGAACATTGCTAAAGCAGGAAGTTGTGTAGACACGTGGAAAGGCAGACCCTGTGATTTGGCCGTGCCTTCAGAAGTGGATGTGGAGAAACTTGCTAAAGGGTATCAGTCCGTCACAGCTGCTGACCCACAGCTCCCAGTCTGGCCAGCCCAGGAGGTAGAAGACCCTTTTGGATTTGCGTTGGAAGCTGGCTGTCAGGCCTGGGACACCAAGCCAAGCATCATGCAGTCGTTTAATGATCCGCTTCTCTGTGGTAAAATACGGCCACGTAAAAAAGCCAGGCAGAAGAGCCAGAAGTCTCCCTGGCAGCCCTTCCCAGATGACCATTCAGCTTGTCTCAGGCCTGGGTCAGAGACTGATGCTGGGAGGGCAGTGAGTCAGGCCCAGGAATCGGTGCAGAGCAAAGTCAAAGGTCCAGGCAAGATGTCACACAGCTCCAGTGGCCCAGCCAGTGTCAGTCAGCTCTCTTCATGGAAAACACCAGAACAGCCTGATCCTGTGTGGGTCCAGTCTTCAGTATCGGGGAAGGGAGAGAAACATCCACCTCCCCGCACCCAACTTCCCTCAAGCTCAGGAAAGATTTCCTCAGGTAACAGTTTTCCCCCACAACAGGCAGGCAGCCCTCTTAAGCGTCCATTTTCTGCTGCTGCTGCTATTGCTGCTGCTGCTGCTGCTG
G
.
X
24363270
.
GATGCAGACTTTAGCCCATGATGTGAAGATGATGACAAGAGATGGCCAGAAATGGAGCCAGGAAGACAAGCTTCAGCTTGAGAGCCAGCTGATCTTAGCGACAGCTGAACCACTGTGTCTTGATCCTTCTGTAGCAGTTGCCTGCACTGCAAACAGGCTGCTGTACAACAAGCAAAAGATGAATACCGACCCGATGAAACGGTGCCTCCAGAGGTATTCGTGGCCCTCTGTAAAGCCACAGCAGGAGCAGTCTGACTGTCCACCTCCTCCTGAGCTGAGAGTGTCGACTTCTGGCCAAAAAGAAGAAAGAAAAGTAGGTCAGCCTTGTGAGCTGAACATTGCTAAAGCAGGAAGTTGTGTAGACACGTGGAAAGGCAGACCCTGTGATTTGGCCGTGCCTTCAGAAGTGGATGTGGAGAAACTTGCTAAAGGGTATCAGTCCGTCACAGCTGCTGACCCACAGCTCCCAGTCTGGCCAGCCCAGGAGGTAGAAGACCCTTTTGGATTTGCGTTGGAAGCTGGCTGTCAGGCCTGGGACACCAAGCCAAGCATCATGCAGTCGTTTAATGATCCGCTTCTCTGTGGTAAAATACGGCCACGTAAAAAAGCCAGGCAGAAGAGCCAGAAGTCTCCCTGGCAGCCCTTCCCAGATGACCATTCAGCTTGTCTCAGGCCTGGGTCAGAGACTGATGCTGGGAGGGCAGTGAGTCAGGCCCAGGAATCGGTGCAGAGCAAAGTCAAAGGTCCAGGCAAGATGTCACACAGCTCCAGTGGCCCAGCCAGTGTCAGTCAGCTCTCTTCATGGAAAACACCAGAACAGCCTGATCCTGTGTGGGTCCAGTCTTCAGTATCGGGGAAGGGAGAGAAACATCCACCTCCCCGCACCCAACTTCCCTCAAGCTCAGGAAAGATTTCCTCAGGTAACAGTTTTCCCCCACAACAGGCAGGCAGCCCTCTTAAGCGTCCATTTTCTGCTGCTGCTGCTATTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCT
G
.
X
24363538
.
CCTGAGCTGAGAGTGTCGACTTCTGGCCAAAAAGAAGAAAGAAAAGTAGGTCAGCCTTGTGAGCTGAACATTGCTAAAGCAGGAAGTTGTGTAGACACGTGGAAAGGCAGACCCTGTGATTTGGCCGTGCCTTCAGAAGTGGATGTGGAGAAACTTGCTAAAGGGTATCAGTCCGTCACAGCTGCTGACCCACAGCTCCCAGTCTGGCCAGCCCAGGAGGTAGAAGACCCTTTTGGATTTGCGTTGGAAGCTGGCTGTCAGGCCTGGGACACCAAGCCAAGCATCATGCAGTCGTTTAATGATCCGCTTCTCTGTGGTAAAATACGGCCACGTAAAAAAGCCAGGCAGAAGAGCCAGAAGTCTCCCTGGCAGCCCTTCCCAGATGACCATTCAGCTTGTCTCAGGCCTGGGTCAGAGACTGATGCTGGGAGGGCAGTGAGTCAGGCCCAGGAATCGGTGCAGAGCAAAGTCAAAGGTCCAGGCAAGATGTCACACAGCTCCAGTGGCCCAGCCAGTGTCAGTCAGCTCTCTTCATGGAAAACACCAGAACAGCCTGATCCTGTGTGGGTCCAGTCTTCAGTATCGGGGAAGGGAGAGAAACATCCACCTCCCCGCACCCAACTTCCCTCAAGCTCAGGAAAGATTTCCTCAGGTAACAGTTTTCCCCCACAACAGGCAGGCAGCCCTCTTAAGCGTCCATTTTCTGCTGCTGCTGCTATTGCTGCT
C
.
X
24363538
.
CCTGAGCTGAGAGTGTCGACTTCTGGCCAAAAAGAAGAAAGAAAAGTAGGTCAGCCTTGTGAGCTGAACATTGCTAAAGCAGGAAGTTGTGTAGACACGTGGAAAGGCAGACCCTGTGATTTGGCCGTGCCTTCAGAAGTGGATGTGGAGAAACTTGCTAAAGGGTATCAGTCCGTCACAGCTGCTGACCCACAGCTCCCAGTCTGGCCAGCCCAGGAGGTAGAAGACCCTTTTGGATTTGCGTTGGAAGCTGGCTGTCAGGCCTGGGACACCAAGCCAAGCATCATGCAGTCGTTTAATGATCCGCTTCTCTGTGGTAAAATACGGCCACGTAAAAAAGCCAGGCAGAAGAGCCAGAAGTCTCCCTGGCAGCCCTTCCCAGATGACCATTCAGCTTGTCTCAGGCCTGGGTCAGAGACTGATGCTGGGAGGGCAGTGAGTCAGGCCCAGGAATCGGTGCAGAGCAAAGTCAAAGGTCCAGGCAAGATGTCACACAGCTCCAGTGGCCCAGCCAGTGTCAGTCAGCTCTCTTCATGGAAAACACCAGAACAGCCTGATCCTGTGTGGGTCCAGTCTTCAGTATCGGGGAAGGGAGAGAAACATCCACCTCCCCGCACCCAACTTCCCTCAAGCTCAGGAAAGATTTCCTCAGGTAACAGTTTTCCCCCACAACAGGCAGGCAGCCCTCTTAAGCGTCCATTTTCTGCTGCTGCTGCTATTGCTGCTGCT
C
.
X
24363538
.
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