| General information of RDP00320 | |
|---|---|
| Gene Symbol: | ZFHX3 |
| RefSeq ID: | NM_001164766 |
| Repeat coordinate: | chr16:72787695-72787716 (-) |
| Repeat size: | 7 |
| Repeat region: | CDS |
| Repeat unit: | CGG |
| Repeat conservation: | PhastCons_score: 0.452; Repeat Conservation from UCSC Genome Browser |
| Amino acid sequence: | GGGGGG |
| Gene expression and GO annotation: | BioGPS |
| Protein expression: | Human Protein Altas |
| Gene conservation: | Gene Conservation from UCSC Genome Browser |
| Mapping repeat track to OMIM: | ||
|---|---|---|
| Phenotype | OMIM_id | Location |
| {Prostate cancer, susceptibility to, somatic}, 176807 (3) | 104155 | 16q22.2-q22.3 |
| Mapping repeat track to DisGeNET: | |||||
|---|---|---|---|---|---|
| Disease_name | RefSeq | Score | NofPmids | NofSnps | Source |
| familial atrial fibrillation | NM_001164766 | 0.30 | 5 | 0 | CTD_human |
| Mapping repeat track to ESP: |
|---|
Chr
Pos
dbSNP_ID
Ref
Alt
Qual
16
72787694
.
AGCCGCCGCCGCCGCC
AGCCGCC,A,AGCCGCCGCC,AGCC
.
16
72787695
.
GCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCA
G
.
16
72787698
.
G
GGAG
.
16
72787701
.
GCCGCCGCCGCCGCCGCCA
G
.
16
72787713
.
GCCGCCA
G
.
16
72787715
.
C
CACT
.
16
72787716
.
GCCA
G
.
| Mapping repeat track to ExAC: |
|---|
Chr
Pos
dbSNP_ID
Ref
Alt
Qual
16
72787695
rs750212424
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GCCGCCGCCGCCGCCGCCACTGCCA,G,ACCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGCCGCCACTGCCA
6379437.33
16
72787696
rs755064334
C
T
6350103.63
16
72787698
rs778916289
GCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGCCGCCACTGCCA
GCCGCCGCCGCCGCCGCCACTGCCA,ACCGCCGCCGCCGCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGCCGCCACTGCCA,G,GCCGCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGCCGCCACTGCCA
6211903.03
16
72787699
rs756322196
C
G,A,CCGCCGA
6203119.65
16
72787700
rs773539831
C
A,T
6186844.69
16
72787701
rs771130644
GCCGCCGCCGCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGCCGCCACTGCCA
GCCGCCGCCGCCGCCGCCACTGCCA,G,ACCGCCGCCGCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGCCGCCACTGCCA
6203950.92
16
72787702
.
C
A,G
6198711.20
16
72787703
rs777045104
C
A,T
6197496.42
16
72787704
rs774872876
GCCGCCGCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGCCGCCACTGCCA
GCCGCCGCCGCCGCCGCCACTGCCA,ACCGCCGCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGCCGCCACTGCCA,G,GCCGCCCCCGCCGCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGCCGCCACTGCCA
1613487.29
16
72787705
rs554891628
C
A
1588016.37
16
72787706
rs769543239
CGCCGCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGCCGCCACT
TGCCGCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGCCGCCACT,C
1596230.02
16
72787707
rs746268093
GCCGCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGCCGCCACTGCCA
GCCGCCGCCGCCGCCGCCACTGCCA,ACCGCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGCCGCCACTGCCA,G
1374714.50
16
72787709
rs775315929
C
T
1374710.33
16
72787710
rs760306096
GCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGCCGCCACTGCCA
ACCGCCGCCACCGCCGCCGCCGCCGCCACTGCCA,GCCGCCGCCGCCGCCGCCACTGCCA,GCCGCCGCCACCGCCGCCACCGCCGCCGCCGCCGCCACTGCCA,G
1371677.67
16
72787712
rs762505281
CGCCGCCACCGCCGCCGCCGCCGCCACT
TGCCGCCACCGCCGCCGCCGCCGCCACT,C,GGCCGCCACCGCCGCCGCCGCCGCCACT
1415272.79
16
72787713
rs761344900
GCCGCCACCGCCGCCGCCGCCGCCACTGCCA
GCCGCCGCCGCCGCCGCCACTGCCA,GCCGCCACCGCCACCGCCGCCGCCGCCGCCACTGCCA,ACCGCCACCGCCGCCGCCGCCGCCACTGCCA,G
1435890.31
16
72787715
rs367818545
CGCCACCGCCGCCGCCGCCGCCACT
C,TGCCACCGCCGCCGCCGCCGCCACT,CACTGCCACCGCCGCCGCCGCCGCCACT
1765773.88
16
72787716
rs751344388
GCCACCGCCGCCGCCGCCGCCA
ACCACCGCCGCCGCCGCCGCCA,GCCGCCGCCGCCGCCGCCA,GCCACCACCGCCGCCGCCGCCGCCA,G
1780511.29
| Mapping repeat track to gnomAD: |
|---|
Chr
Pos
dbSNP_ID
Ref
Alt
Qual
16
72787694
rs775101099
AGCCGCCGCCGCC
AGCCGCCGCCGCCGCCGCC,AGCC,AGCCGCCGCCGCCGCC,AGCCGCCGCC,A,AGCCGCC
1135871.65
16
72787695
rs750212424
GCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCA
GCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCA,G
499691.96
16
72787697
rs758214401
C
CGGA
496149.59
16
72787698
rs778916289
GCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGCCGCCACTGCCA
G,GCCGCCGCCGCCGCCGCCACTGCCA,GCCGCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGCCGCCACTGCCA
482386.20
16
72787699
rs756322196
C
CCGCCGA
481741.28
16
72787700
rs773539831
C
T
481058.70
16
72787701
rs771130644
GCCGCCGCCGCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGCCGCCACTGCCA
GCCGCCGCCGCCGCCGCCACTGCCA,GCCGCCGCCGCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGCCGCCACTGCCA,GCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGCCGCCACTGCCA,G
456135.73
16
72787704
rs774872876
GCCGCCGCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGCCGCCACTGCCA
GCCGCCGCCGCCGCCGCCACTGCCA,G,ACCGCCGCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGCCGCCACTGCCA,GCCGCCGCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGCCGCCACTGCCA
51381.84
16
72787706
rs769543239
C
T
49226.94
16
72787707
rs746268093
GCCGCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGCCGCCACTGCCA
GCCGCCGCCGCCGCCGCCACTGCCA,G
42315.57
16
72787709
rs775315929
C
CGCT
42539.03
16
72787710
rs760306096
GCCGCCGCCA
ACCGCCGCCA,GCCGCCGCCACCGCCGCCA,G
47684.36
16
72787712
rs762505281
C
T
46883.11
16
72787713
rs761344900
GCCGCCACCGCCGCCGCCGCCGCCACTGCCA
GCCGCCGCCGCCGCCGCCACTGCCA,G,GCCGCCACCGCCACCGCCGCCGCCGCCGCCACTGCCA,ACCGCCACCGCCGCCGCCGCCGCCACTGCCA,TCCGCCACCGCCGCCGCCGCCGCCACTGCCA
91526.79
16
72787715
rs367818545
CGCCACCGCCGCCGCCGCCGCCACT
C,TGCCACCGCCGCCGCCGCCGCCACT
110699.73
16
72787716
rs751344388
GCCA
ACCA,G
116478.55
| Mapping repeat track to Kaviar: |
|---|
Chr
Pos
dbSNP_ID
Ref
Alt
Qual
16
72787693
.
GAGCCGCCGCC
GAGCCGCCCGCC
.
16
72787694
rs767179754
AGCC
A
.
16
72787694
rs760218221
AGCCGCC
A
.
16
72787694
rs780140830
AGCCGCCGCC
A
.
16
72787694
rs757152265
AGCCGCCGCCGCC
A,AGCC,AGCCGCC,AGCCGCCGCC,AGCCGCCGCCGCCGCC,AGCCGCCGCCGCCGCCGCC
.
16
72787695
.
GCCGCCGCCG
G
.
16
72787695
.
GCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCACCGCCGC
GCCGCCGCCGCCGCCACCGCCGC
.
16
72787695
rs765152994
GCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCA
G
.
16
72787695
rs750212424
GCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGCCGCCACTGCCA
G
.
16
72787696
rs755064334
C
T
.
16
72787697
rs758214401
C
CCAGGCAGTGGTACGA
.
16
72787698
rs778916289
G
A
.
16
72787698
rs781609559
GCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCA
G
.
16
72787698
rs748381813
GCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGCCGCCACTGCCA
G
.
16
72787699
rs748193178
C
A,CCGCCGA,G
.
16
72787699
rs756322196
C
CCGCCGA
.
16
72787700
rs773539831
C
A,T
.
16
72787701
rs771130644
G
A
.
16
72787701
rs778016374
GCCGCCGCCGCCGCCGCCA
G
.
16
72787701
rs749325118
GCCGCCGCCGCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGCCGCCACTGCCA
G
.
16
72787703
rs777045104
C
A
.
16
72787704
.
G
A
.
16
72787704
rs771374165
GCCGCCGCCGCCGCCA
G
.
16
72787704
rs774872876
GCCGCCGCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGCCGCCACTGCCA
G
.
16
72787705
rs554891628
C
A
.
16
72787706
rs769543239
C
T
.
16
72787707
.
G
C
.
16
72787707
rs746268093
GCCGCCGCCGCCA
G
.
16
72787707
rs772394749
GCCGCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGCCGCCACTGCCA
G
.
16
72787709
rs775315929
C
T
.
16
72787710
.
G
A
.
16
72787710
rs760306096
G
GCCGCCGCCA
.
16
72787710
rs775190963
GCCGCCGCCA
G
.
16
72787710
rs763677001
GCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGCCGCCACTGCCA
G
.
16
72787712
rs762505281
C
G,T
.
16
72787713
.
G
A
.
16
72787713
rs761344900
G
GCCGCCA
.
16
72787713
rs776006250
GCCGCCA
G
.
16
72787713
rs765105433
GCCGCCACCGCCGCCGCCGCCGCCACTGCCA
G
.
16
72787715
rs367818545
C
CACT
.
16
72787715
rs750348888
CGCCACCGCCGCCGCCGCCGCCACT
C
.
16
72787716
rs751344388
G
GCCA
.
16
72787716
rs766266415
GCCA
G
.
16
72787716
rs756410079
GCCACCGCCGCCGCCGCCGCCA
G
.