| General information of RDP00194 | |
|---|---|
| Gene Symbol: | RASGEF1C |
| RefSeq ID: | NM_175062 |
| Repeat coordinate: | chr5:180209110-180209149 (-) |
| Repeat size: | 13 |
| Repeat region: | 5' UTR |
| Repeat unit: | CGG |
| Repeat conservation: | PhastCons_score: 0.002; Repeat Conservation from UCSC Genome Browser |
| Amino acid sequence: | - |
| Gene expression and GO annotation: | BioGPS |
| Protein expression: | Human Protein Altas |
| Gene conservation: | Gene Conservation from UCSC Genome Browser |
| Mapping repeat track to gnomAD: |
|---|
Chr
Pos
dbSNP_ID
Ref
Alt
Qual
5
180209110
rs768278930
CCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCG
CCCG,C,CCCGCCGCCG,CCCGCCGCCGCCGCCGCCG,CCCGCCGCCGCCGCCG,CCCGCCG
10780333.19
5
180209113
.
G
GCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGACCGGGGCGCCGC
8705873.42
5
180209116
rs578165911
G
GCCGCCGCCGCCGCCGCCGACCGGGGCGCCGC
8684665.39
5
180209117
.
CCGCCGCCGCCGCCG
C
8430480.63
5
180209120
.
C
A
8270458.78
5
180209122
.
G
GCCGCCGCCGCCGACCGGGGCGCCGC
8291762.84
5
180209123
.
C
T
8167404.40
5
180209125
.
G
GCCGCCGCCGACCGGGGCGCCGC
8187408.53
5
180209128
.
G
GC
7705340.66
5
180209129
.
CCGCCGCCGCCGCCG
CCCGCCGCCGCCG,CCCGCCG,C
7403089.41
5
180209131
.
GCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCCGA
G,GACCGCCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCCGA
7357293.84
5
180209134
.
GCCGCCGCCGCCGCCGCCCGA
G
1232209.42
5
180209135
.
C
A
20367.33
5
180209146
.
G
GA
8698.61
5
180209147
.
C
T
9058.77
| Mapping repeat track to Kaviar: |
|---|
Chr
Pos
dbSNP_ID
Ref
Alt
Qual
5
180209110
.
CCCG
C
.
5
180209110
.
CCCGCCG
C
.
5
180209110
.
CCCGCCGCCG
C
.
5
180209110
.
CCCGCCGCCGCCG
C
.
5
180209110
rs768278930
CCCGCCGCCGCCGCCG
CCCGCCGCCG,C
.
5
180209110
.
CCCGCCGCCGCCGCCGCCG
CCCGCCGCCG,CCCGCCGCCGCCG,C
.
5
180209110
.
CCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCG
CCCG,CCCGCCG,CCCGCCGCCG,CCCGCCGCCGCCG,CCCGCCGCCGCCGCCG,CCCGCCGCCGCCGCCGCCG,C
.
5
180209110
.
CCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCG
CCCG,CCCGCCGCCG,CCCGCCGCCGCCGCCG,CCCGCCGCCGCCGCCGCCG,C
.
5
180209116
rs578165911
G
C
.
5
180209119
rs538873512
G
C
.
5
180209142
.
CG
C
.
5
180209143
.
GCCGCCGCCCGA
G
.
5
180209145
.
C
CCG
.
5
180209149
.
G
C
.